دیپارتمنت تعلیمات اسلامی  در سال 1390 در چوکات پوهنحی شرعیات شروع به فعالیت نمود. در این شاخه از علوم دینی، تعامل با احکام دین مبین اسلام مدنظر بوده وهدف تربیت متخصصینی است که ضمن آشنایی با احکام دین مبین اسلام ، نسبت به مسائل روز و تحولات اجتماعی درک درستی داشته باشند. غایت تعیین شده رشته ی تعلیمات اسلامی هم تربیه کادرهای مسلکی و حرفه ای در عرصه علوم اسلامی است. محصلین این دیپارتمنت بعد از پایان هشت سمستر و چهار سال تحصیلی در نهاد های مرتبط با رشته تحصیلی شان به کار گماشته می شوند. در حال حاضر دیپارتمنت مذکور دارای چهار کدر علمی می باشد.

دیپارتمنت تعلیمات اسلامی  به عنوان نیمی از بدنه پوهنحی شرعیات و علوم اسلامی  در چوکات مؤسسه تحصیلات عالی اسلامی الغیاث  فعالیت می نماید و یقینا مرام این دیپارتمنت نیز به تاسی از اهداف و مرام مؤسسه تحصیلات عالی اسلامی الغیاث و پوهنحی شرعیات و علوم اسلامی  می باشد. این دیپارتمنت برای اجرای رسالت خود این اهداف را مد نظر دارد:

1.      تلاش در جهتت تربیت نسلی مسلمان و مؤمن که بتواند حقایق اسلامی را درک و با بصیرت آنرا بیان دارد.

2.      نشر و پخش علوم شرعی در جامعه از طریق محصلان در رشته.

3.      تلاش گسرده در جهت تحقق بخشیدن بر منهج اسلامی بدور از افراط و تفریط.

4.      مشارکت و سهم گیری در حفاظت از میراث بزرگ علمی سلف صالح از طریق پخش و نشر علوم اسلامی آموخته شده.

5.      رفع مشکلات و شبهات عقیدتی، فکری و قضایای معاصر که نیاز به تبیین و روشنگری دارد.

6.      تلاش در جهت خود کفایی جامعه افغانی در علوم اسلامی در خلال تربیت کادرهای علمی و مسلکی در علوم اسلامی

7.      تربیت کادرهای ورزیده در امور عدلی و قضایی در سطح کشور.

8.      تربیت نسل متعهد و متخصص معارف اسلامی در معارف افغانستان.